MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 plasmid pHALXA01

Total Repeats: 10748

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015658	AAG	2	6	8	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015658	AG	3	6	45	50	50 %	0 %	50 %	0 %	336251751
3	NC_015658	CTC	2	6	69	74	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251751
4	NC_015658	TCA	2	6	91	96	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251751
5	NC_015658	CTC	2	6	114	119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251751
6	NC_015658	GCA	2	6	187	192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251751
7	NC_015658	CTT	2	6	257	262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251751
8	NC_015658	CT	3	6	282	287	0 %	50 %	0 %	50 %	336251751
9	NC_015658	CCT	2	6	348	353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251751
10	NC_015658	CGAT	2	8	438	445	25 %	25 %	25 %	25 %	336251751
11	NC_015658	GCCG	2	8	447	454	0 %	0 %	50 %	50 %	336251751
12	NC_015658	TG	3	6	456	461	0 %	50 %	50 %	0 %	336251751
13	NC_015658	CGA	2	6	491	496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251751
14	NC_015658	GATC	2	8	498	505	25 %	25 %	25 %	25 %	336251751
15	NC_015658	AGT	2	6	595	600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251751
16	NC_015658	TAG	2	6	613	618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251751
17	NC_015658	CTT	2	6	626	631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251751
18	NC_015658	TTC	2	6	735	740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251751
19	NC_015658	TAA	2	6	833	838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015658	AAGC	2	8	885	892	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015658	GACG	2	8	978	985	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015658	TCC	2	6	1034	1039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_015658	TTC	2	6	1055	1060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015658	TC	3	6	1319	1324	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015658	CTCG	2	8	1368	1375	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015658	TGGG	2	8	1473	1480	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015658	ATT	2	6	1522	1527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015658	AC	3	6	1531	1536	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015658	TGG	2	6	1600	1605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015658	AGA	2	6	1705	1710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015658	GTT	2	6	1776	1781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015658	TTC	2	6	1803	1808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015658	CCG	2	6	1830	1835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_015658	GTC	2	6	1853	1858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015658	GTT	2	6	1916	1921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015658	GTC	2	6	2121	2126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251752
37	NC_015658	C	6	6	2139	2144	0 %	0 %	0 %	100 %	336251752
38	NC_015658	CGC	2	6	2181	2186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_015658	TCCTC	2	10	2197	2206	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
40	NC_015658	CGC	3	9	2232	2240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_015658	CG	3	6	2242	2247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015658	GCA	2	6	2251	2256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015658	CAC	2	6	2289	2294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_015658	CCT	2	6	2318	2323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_015658	TC	3	6	2355	2360	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015658	TCTCT	2	10	2370	2379	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_015658	CTG	2	6	2405	2410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015658	TCG	2	6	2430	2435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015658	CTC	2	6	2490	2495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_015658	ATT	2	6	2508	2513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015658	CT	3	6	2531	2536	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015658	CT	3	6	2546	2551	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015658	CT	3	6	2557	2562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015658	TG	3	6	2642	2647	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015658	AT	3	6	2674	2679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015658	GCC	2	6	2774	2779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_015658	GTGC	2	8	2828	2835	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015658	TGG	2	6	2874	2879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015658	TAC	2	6	2910	2915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015658	CTG	2	6	2991	2996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015658	TAA	2	6	3014	3019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015658	TCGAA	2	10	3076	3085	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_015658	CTT	2	6	3089	3094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015658	AGG	2	6	3147	3152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015658	TA	3	6	3243	3248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015658	A	6	6	3253	3258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015658	TCCTC	2	10	3322	3331	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
68	NC_015658	TGC	2	6	3345	3350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015658	AGTAC	2	10	3389	3398	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_015658	AGG	2	6	3462	3467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015658	TACT	2	8	3512	3519	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_015658	AGT	2	6	3586	3591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015658	GAT	2	6	3617	3622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015658	CATTC	2	10	3771	3780	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_015658	TCC	2	6	3858	3863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_015658	ATG	2	6	3911	3916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015658	TCT	2	6	3957	3962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015658	AGA	2	6	4010	4015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015658	TCT	2	6	4021	4026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015658	GTTC	2	8	4033	4040	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015658	AG	3	6	4102	4107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015658	AATGA	2	10	4146	4155	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015658	TCG	2	6	4172	4177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015658	GT	3	6	4207	4212	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015658	CTG	2	6	4255	4260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251753
86	NC_015658	GAC	3	9	4264	4272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251753
87	NC_015658	ATC	2	6	4306	4311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251753
88	NC_015658	CGA	2	6	4335	4340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251753
89	NC_015658	C	6	6	4638	4643	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
90	NC_015658	ACTC	2	8	4681	4688	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015658	AG	3	6	4769	4774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015658	GTCT	2	8	4810	4817	0 %	50 %	25 %	25 %	336251754
93	NC_015658	AAC	2	6	4958	4963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251754
94	NC_015658	CG	3	6	5049	5054	0 %	0 %	50 %	50 %	336251754
95	NC_015658	GAAA	2	8	5061	5068	75 %	0 %	25 %	0 %	336251754
96	NC_015658	ATT	2	6	5147	5152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336251754
97	NC_015658	CGG	2	6	5215	5220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251754
98	NC_015658	ATC	2	6	5278	5283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251754
99	NC_015658	AAC	2	6	5300	5305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251754
100	NC_015658	AGG	2	6	5321	5326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251754
101	NC_015658	TGA	2	6	5328	5333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251754
102	NC_015658	CT	3	6	5446	5451	0 %	50 %	0 %	50 %	336251754
103	NC_015658	ACT	2	6	5488	5493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251754
104	NC_015658	ATCT	2	8	5501	5508	25 %	50 %	0 %	25 %	336251754
105	NC_015658	TTC	2	6	5515	5520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015658	TTTA	2	8	5528	5535	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015658	ACA	2	6	5563	5568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015658	CCT	2	6	5577	5582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_015658	CCA	2	6	5668	5673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336251755
110	NC_015658	CGT	2	6	5675	5680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251755
111	NC_015658	GCGT	2	8	5767	5774	0 %	25 %	50 %	25 %	336251755
112	NC_015658	GTC	2	6	5860	5865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251755
113	NC_015658	ACG	2	6	5919	5924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251755
114	NC_015658	GTC	3	9	5951	5959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251755
115	NC_015658	CTG	2	6	6016	6021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251755
116	NC_015658	CAA	2	6	6093	6098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251755
117	NC_015658	TCG	2	6	6105	6110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251755
118	NC_015658	GA	3	6	6125	6130	50 %	0 %	50 %	0 %	336251755
119	NC_015658	ACG	2	6	6220	6225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251755
120	NC_015658	TTC	2	6	6275	6280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251755
121	NC_015658	AAC	2	6	6301	6306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251755
122	NC_015658	TGC	2	6	6308	6313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251755
123	NC_015658	GA	3	6	6354	6359	50 %	0 %	50 %	0 %	336251755
124	NC_015658	CT	3	6	6458	6463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015658	TGA	2	6	6587	6592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015658	CTA	2	6	6700	6705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015658	GCC	3	9	6764	6772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_015658	TC	3	6	6785	6790	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_015658	TCCG	2	8	6814	6821	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015658	TCG	2	6	6869	6874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015658	CTG	2	6	6899	6904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015658	AG	3	6	6908	6913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015658	TCG	2	6	6922	6927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251756
134	NC_015658	GAT	2	6	6960	6965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251756
135	NC_015658	GTC	2	6	6981	6986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251756
136	NC_015658	CGA	3	9	6992	7000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251756
137	NC_015658	TCG	2	6	7048	7053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251756
138	NC_015658	GA	3	6	7060	7065	50 %	0 %	50 %	0 %	336251756
139	NC_015658	CTG	2	6	7077	7082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251756
140	NC_015658	TGG	2	6	7114	7119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336251756
141	NC_015658	TCG	2	6	7138	7143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251756
142	NC_015658	CG	3	6	7171	7176	0 %	0 %	50 %	50 %	336251756
143	NC_015658	TCG	2	6	7195	7200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251756
144	NC_015658	TGA	2	6	7391	7396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251756
145	NC_015658	GAC	2	6	7418	7423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251756
146	NC_015658	AATC	2	8	7556	7563	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_015658	AGTG	2	8	7604	7611	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015658	TAC	2	6	7627	7632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_015658	ATTCG	2	10	7653	7662	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
150	NC_015658	CGA	3	9	7738	7746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251757
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152	NC_015658	GTC	3	9	7764	7772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251757
153	NC_015658	GAC	2	6	7798	7803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251757
154	NC_015658	CGA	2	6	7805	7810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251757
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156	NC_015658	CGG	2	6	7874	7879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251757
157	NC_015658	CGA	2	6	7919	7924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251757
158	NC_015658	ACT	2	6	7931	7936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251757
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160	NC_015658	GAG	2	6	7986	7991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251757
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164	NC_015658	CGA	2	6	8177	8182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251757
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166	NC_015658	CGA	2	6	8417	8422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251757
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179	NC_015658	GAC	2	6	8883	8888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251757
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182	NC_015658	ATA	2	6	9201	9206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_015658	ATG	2	6	9224	9229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
184	NC_015658	TAT	2	6	9238	9243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_015658	TAG	2	6	9254	9259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_015658	CGC	2	6	9327	9332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
188	NC_015658	AAT	2	6	9335	9340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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190	NC_015658	GATA	2	8	9449	9456	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
191	NC_015658	TA	3	6	9455	9460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_015658	AAC	2	6	9474	9479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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273	NC_015658	CGGC	2	8	12927	12934	0 %	0 %	50 %	50 %	336251760
274	NC_015658	CGA	2	6	12951	12956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251760
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289	NC_015658	CGT	2	6	13588	13593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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291	NC_015658	GCA	2	6	13625	13630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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401	NC_015658	ATCGA	2	10	18707	18716	40 %	20 %	20 %	20 %	336251764
402	NC_015658	GTC	2	6	18729	18734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251764
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405	NC_015658	TCGA	2	8	18869	18876	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
406	NC_015658	TC	3	6	18962	18967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
407	NC_015658	TG	3	6	18974	18979	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
408	NC_015658	CG	3	6	19016	19021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
409	NC_015658	CGA	2	6	19107	19112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251765
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411	NC_015658	GCCG	2	8	19151	19158	0 %	0 %	50 %	50 %	336251765
412	NC_015658	CGT	3	9	19172	19180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251765
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